Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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