Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Calcoco2A2A6M5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms