Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms