Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
2210011C24RikA0A087WQ89 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms