Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm17190V9GX38 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm17190V9GX38 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm17190V9GX38 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm17190V9GX38 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm17190V9GX38 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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