Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Top3bQ9Z321 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Top3bQ9Z321 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Top3bQ9Z321 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Top3bQ9Z321 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Top3bQ9Z321 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Top3bQ9Z321 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Top3bQ9Z321 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Top3bQ9Z321 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Top3bQ9Z321 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Top3bQ9Z321 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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