Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms