Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd3Q9Z2D8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms