Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms