Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms