Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prkab1Q9R078 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prkab1Q9R078 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prkab1Q9R078 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prkab1Q9R078 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms