Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf25Q9QZR0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms