Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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