Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc5Q9QX29 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms