Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tgm1Q9JLF6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tgm1Q9JLF6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tgm1Q9JLF6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tgm1Q9JLF6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tgm1Q9JLF6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tgm1Q9JLF6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tgm1Q9JLF6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tgm1Q9JLF6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tgm1Q9JLF6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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