Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scube2Q9JJS0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scube2Q9JJS0 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scube2Q9JJS0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scube2Q9JJS0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scube2Q9JJS0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scube2Q9JJS0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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