Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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