Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cul5Q9D5V5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cul5Q9D5V5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Cul5Q9D5V5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cul5Q9D5V5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cul5Q9D5V5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cul5Q9D5V5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Cul5Q9D5V5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cul5Q9D5V5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cul5Q9D5V5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cul5Q9D5V5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cul5Q9D5V5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cul5Q9D5V5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cul5Q9D5V5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cul5Q9D5V5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul5Q9D5V5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms