Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce1Q9D495 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms