Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ddx56Q9D0R4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ddx56Q9D0R4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ddx56Q9D0R4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ddx56Q9D0R4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ddx56Q9D0R4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ddx56Q9D0R4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ddx56Q9D0R4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ddx56Q9D0R4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ddx56Q9D0R4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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