Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2e1Q9D0D5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms