Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snw1Q9CSN1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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