Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms