Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed6Q9CQG0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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