Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Rab5aQ9CQD1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Rab5aQ9CQD1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Rab5aQ9CQD1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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