Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cntnap4Q99P47 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cntnap4Q99P47 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cntnap4Q99P47 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cntnap4Q99P47 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Cntnap4Q99P47 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cntnap4Q99P47 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cntnap4Q99P47 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cntnap4Q99P47 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cntnap4Q99P47 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cntnap4Q99P47 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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