Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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PtprtQ99M80 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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