Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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