Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf19Q99KP6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms