Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms