Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco4Q91WU4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms