Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms