Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyripQ8K3I4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms