Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm48Q8K2X2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms