Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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