Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc27Q8CD92 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc27Q8CD92 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc27Q8CD92 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc27Q8CD92 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc27Q8CD92 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc27Q8CD92 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ttc27Q8CD92 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc27Q8CD92 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc27Q8CD92 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc27Q8CD92 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc27Q8CD92 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ttc27Q8CD92 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc27Q8CD92 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc27Q8CD92 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc27Q8CD92 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ttc27Q8CD92 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ttc27Q8CD92 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc27Q8CD92 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc27Q8CD92 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ttc27Q8CD92 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Ttc27Q8CD92 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ttc27Q8CD92 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ttc27Q8CD92 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ttc27Q8CD92 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ttc27Q8CD92 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms