Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Nhlrc3Q8CCH2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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