Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf2Q8CB19 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf2Q8CB19 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf2Q8CB19 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phtf2Q8CB19 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phtf2Q8CB19 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phtf2Q8CB19 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phtf2Q8CB19 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phtf2Q8CB19 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.05■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phtf2Q8CB19 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms