Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9U4

Gm9958, MCG147145, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9958Q8C9U4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm9958Q8C9U4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms