Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ubqln3Q8C5U9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ubqln3Q8C5U9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ubqln3Q8C5U9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ubqln3Q8C5U9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ubqln3Q8C5U9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ubqln3Q8C5U9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ubqln3Q8C5U9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ubqln3Q8C5U9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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