Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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