Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtpaQ8BWP5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms