Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms