Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms