Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LnpkQ7TQ95 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms