Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GypcQ78HU7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms