Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssx9Q6XAS3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms