Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms