Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6DFW0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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