Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja3Q64448 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms